すべてがFになる

神南大学工学部建築学科3年の西之園萌絵（武井咲）は、同学科の准教授の犀川創平（綾野剛）に、ある報告をした。“もっとも神に近い人間”と犀川も絶賛する天才プログラマーの真賀田四季（早見あかり）に、面会して来たというのだ。四季は、事情により幽閉されているが、萌絵は、県知事の叔母に頼んで面会にこぎつけた。
犀川がそれをうらやんでいると、助教の国枝桃子（水沢エレナ）がやって来る。犀川は国枝に、これから同大学の極地環境研究センターに出かけると話す。犀川に好意を持つ萌絵は、一緒に付いて行く。　

何者かにより低温実験室に閉じ込められた萌絵（武井咲）は、犀川（綾野剛）に救助され一命を取り留める。集中治療室に運ばれた萌絵の元へ、叔父の捷輔（吉田鋼太郎）がやってくる。捷輔は犀川に、萌絵が事件のことを調べているのは、犀川に認められたいからだろう、と話した。
翌朝、一般病棟に移った萌絵のそばには犀川がいた。犀川は萌絵に、犯人の目星が付いているだろう、誰だと思うか、と聞く。萌絵は、犀川の推察と同じだと答え、自分の代わりにそれを確かめて来てほしいと頼む。
同じ頃、極地環境研究センターに里佳（市川由衣）が出勤して来る。早い出勤に驚く守衛に里佳は、出張先から直接戻ったのだ、と明かした。

萌絵（武井咲）は犀川（綾野剛）を誘い、香山という一家が暮らす日本家屋にやってくる。名目は「歴史的建造物の調査」だが、萌絵の興味は香山家に伝わる壺と匣（はこ）にあった。鍵のかかった匣には対となる壺があり、中に鍵らしきものが入っているがそれを取り出すことはできない。50年前、当主で仏画師の香山風采の死亡事件が起こったとき、壺に風采の血痕が付着していた。それを見た警察が匣を開けようとしたが、息子で同じく仏画師の林水がそれを拒んだという。
いわく付きの壺と匣を見たい萌絵は、犀川とともにそれが置かれている蔵まで来るが使用人に制される。それでも粘る萌絵を、現在の当主・香山林水（横内正）の妻であるフミ（真野響子）が厳しく制した。
別の日、萌絵、犀川、萌絵の叔父・捷輔（吉田鋼太郎）がレストランにいると、林水の長女で漫画家のマリモ（原田夏希）がやってくる。捷輔の妻が風采の画が好きだったことから、捷輔はマリモと知り合ったという。

萌絵（武井咲）は、大広間に集まった香山家の人々に病院から失踪したマリモ（原田夏希）が、林水（横内正）の死に関連している可能性があると切り出した。一方、犀川（綾野剛）は一人、部屋の隅にいた。
また、刑事の鵜飼（戸次重幸）は、屋敷の裏門付近にマリモのタバコの吸い殻が落ちていたこと、さらに、林水の息子・多可志（髙橋洋）が屋敷を売却しようとして林水に反対されていたことを挙げ、疑いの目を向ける。多可志は、この家は呪われているから売却したほうがいいのだ、とつぶやく。
その後、萌絵と犀川は、ヒーローのおもちゃで遊ぶ多可志の息子・祐介（髙橋來）に声をかける。ヒーローは強いのかと聞く萌絵に、祐介は「もういない」と答える。不思議に思った萌絵は外れていた電池をヒーローにはめてやる。動き出したヒーローを見た祐介は「いた」と答えた。そのやりとりを見ていた犀川は、何かに気づく。

西之園萌絵（武井咲）と犀川創平（綾野剛）は、ゼミ旅行と称して真賀田四季（早見あかり）の研究所がある島へやってくる。
15年前、当時14歳だった四季は両親を殺害した容疑で裁判にかけられるが、心神喪失が認められ無罪となっていた。天才プログラマーとしてその名をはせた四季の事件は、世間を大きく騒がせた。以来、四季は研究所にこもり、一度も外出していないという。
特別な許可を得て研究所を訪ねた萌絵と犀川は、不在の所長・新藤清二（冨家規政）に代わり副所長の山根幸宏（利重剛）から最新鋭の管理システムについて説明を受ける。そこへ、四季からの緊急コールが入った。地下にいる四季の部屋へと駆けだした山根に続き、萌絵と犀川も走り出した。

西之園萌絵（武井咲）と犀川創平（綾野剛）は、真賀田四季（早見あかり）を殺害した犯人が、コンピュータシステムで厳重に監視されている研究所の中にどうやって侵入し、どこへ消えたのか、手がかりをつかめずにいた。
そんな折、主任プログラマーの島田文子（山田真歩）が、翌朝10時に記者が所長の新藤清二（冨家規政）を訪ねて来る約束になっていることを突き止める。記者は船で来るため、その時間に港に行けば外部と連絡を取ることができる。しかし、副所長の山根幸宏（利重剛）は明日を待たずに、コンピュータのオペレーションを別のシステムに切り替え、通信を復旧させることを決めた。そうすればすぐに警察にも通報できるが、山根は萌絵と犀川に四季が殺害されたことは黙っていてほしいと頼む。四季の死は研究所の死を意味するから、四季の妹の未来（早見あかり）を代役に仕立てることで、研究所を維持するつもりだと言う。

西之園萌絵（武井咲）は、従兄で有名作家の大御坊安朋（小松和重）から緊急事態だと連絡を受け、彼が主催するイベント会場にやってくる。そこは模型とフィギュアが展示された「モデラーズフェス」で、有名モデラーや造形師が作った作品にマニアが集まり、雑誌記者の儀同世津子（臼田あさ美）も取材に来ていた。
そんな会場の控室で大御坊は萌絵に、SFのコスプレスーツを着てくれと頼む。それを着るはずだった筒見明日香（山川紗弥）と連絡が取れなくなったため、萌絵に代役としてイベントに出てほしいと言う。
同じ頃、犀川創平（綾野剛）も喜多北斗（小澤征悦）と会場にいた。ふたりは大御坊の中学高校の同級生で招待されていたのだ。

西之園萌絵（武井咲）は、筒見紀世都（中島歩）のアトリエに明日香（山川紗弥）の等身大のフィギュアがあったこと、異常としか思えない一面を目撃したことから、明日香を偏愛する紀世都が彼女を殺害したのでは、と犀川創平（綾野剛）に話す。
そこへ、儀同世津子（臼田あさ美）がやってくる。犀川に対する世津子の親しげな態度にいらだち萌絵は研究室を出る。すると、浜中深志（岡山天音）が来て封筒を手渡した。紀世都から送られたその手紙を読んだ萌絵はどこかへと向かうが、そのとき、寺林高司（山本耕史）から連絡が入る。寺林はどうしても確かめたいことがあり病院を抜け出したという。萌絵が問い詰めると、紀世都のところに行くつもりだと明かした。

スーツケースを手にした西之園萌絵（武井咲）は、「ユーロパーク」に到着した。パーク内の貸別荘で犀川ゼミの旅行が計画されていたが、大株主である萌絵は前乗りしてパークを運営するナノクラフト社長の塙理生哉（城田優）と食事の約束をしていた。塙は現在のIT業界で一番の成功者と言われる人物で、萌絵との縁談が浮上したこともあった。
事情を知った儀同世津子（臼田あさ美）は、犀川創平（綾野剛）に萌絵が心配ではないのか、と聞く。
萌絵を出迎えたのは、塙の秘書の新庄久美子（青山倫子）だった。萌絵は久美子にパーク内のホテルに案内され、早速、部屋に入った萌絵は、電話の横のメモに書かれた不可思議なメッセージに目を留める。すぐに犀川に電話をし、それが自分の死を予告するものではないか、と話すが、犀川は単なるいたずらで気にすることはないと答える。

西之園萌絵（武井咲）は、ホテルの自室のベッドで目を覚ます。そして、犀川創平（綾野剛）に会いに行くと、自分は夢を見ているのではない、と確認するようにつぶやいた。
ホテルに戻った萌絵は、鵜飼大介（戸次重幸）に電話し「ユーロパーク」に真賀田四季（早見あかり）が潜伏しているから捜索要請をしてくれ、と頼む。やがて、鵜飼から連絡を受けた愛知県警の芝池護（小林隆）がやってくる。萌絵は芝池に、自分とともに塙理生哉（城田優）のところへ行き、四季の居場所を聞き出して欲しいと言う。
萌絵と芝池は、ナノクラフト社で塙と藤原博（鈴木一真）と面会する。萌絵は、自分に睡眠薬を飲ませ四季のいる場所に連れていったはずだ、と塙を問いただすが、塙は萌絵の妄想だと言って取り合わない。