遊戯王VRAINS

VR空間・LINK VRAINSをデュエルによって崩壊させようとたくらむハッカー集団・ハノイの騎士。高校生の藤木遊作は正体不明のアバター・Playmakerとして彼らを相手にデュエルを繰り広げていた。

遊作は入手した謎の生命体を人質にハノイの騎士にデュエルを申し込む。遊作のデッキでは勝てないと計算した謎の生命体はData Stormを発生させ、未知のデュエル・スピードデュエルを展開させる。

謎の生命体に秘められた情報の調査を開始する遊作。その一方、ハノイの騎士とのデュエルの目撃情報から、PlaymakerはLINK VRAINSを救った英雄として大きな話題になっていた。

LINK VRAINSにハノイの騎士が突然現れる。その正体はPlaymakerを狙うカリスマデュエリスト・Go鬼塚だった。彼はある児童養護施設への恩返しと子供たちの笑顔のためにデュエルしていて…。

プロレスのような演出でデュエルをエンターテイメントにするGo鬼塚のプレースタイルに興味を持ち始めたPlaymaker。そのデュエルを受け入れるように彼はエースモンスター、デコード・トーカーを召喚し…。

LINK VRAINSではカリスマデュエリスト・ブルーエンジェルとして活躍する財前葵。彼女は兄である財前晃に認められるため、LINK VRAINSの人々の前でPlaymakerにデュエルを申し込む。

ブルーエンジェルの背後にハノイの騎士の気配を感じた遊作は、その真意を探るためにデュエルを受ける。しかし、効果ダメージを使いこなすブルーエンジェルの戦術にPlaymakerはじりじりと追い詰められ…。

ハノイの騎士が仕掛けたプログラムの影響で昏睡状態になった財前葵に責任を感じる遊作は、草薙たちと原因について調べ始める。しかしその時、街のモニターに昏睡状態のはずのブルーエンジェルが映し出され…。

葵を蝕むウイルスを除去するプログラムと、イグニスと呼ばれるAi（アイ）を懸けたデュエルが開始。Playmakerとリボルバーの一進一退の攻防が続くと思われたその時、リボルバーが衝撃のスキルを発動する。

強力なスキルによって圧倒的な力を手にしたリボルバーの猛攻に、Playmakerは防戦を強いられる。さらにStorm Accessで逆転のカードを手に入れたかと思われた時、リボルバーの作戦が発動し…。

リボルバーが明かした真実に困惑するPlaymakerは、リボルバーのエースモンスター、ヴァレルロード・ドラゴンの強烈な一撃に倒れる。意識が遠のいていく中、Playmakerの頭の中に謎の声が響く。

ファイアウォール・ドラゴンを従えたPlaymakerは最後の力を振り絞り、リボルバーのヴァレルロード・ドラゴンに対抗。それぞれの思惑を胸に秘めた2人の意志と、2体のドラゴンが激突する。

リボルバーとの激闘を終えた遊作は、草薙と共にイグニスについての情報を分析する。一方、LINK VRAINSではPlaymakerを目撃したという謎のデュエリスト・ゴーストガールが取材に応じていた。

10年前の事件に興味を持ったゴーストガールは、PlaymakerにAi（アイ）を懸けたデュエルを申し込む。遊作はLINK VRAINSへ向かい、10年前の事件の真相を暴くべく危険を承知で挑戦を受ける。

変幻自在の戦術により、先の読めないデュエルを繰り広げるゴーストガール。Playmakerもまた、ゴーストガールの動きを冷静に分析しつつ「Storm Access」のチャンスを窺っていた。

10年前の事件を探るため、PlaymakerはSOLテクノロジー社のシステムに侵入して深部にあるデータバンクへ向かう。しかし、Playmakerの前にデュエルAIプログラムが立ちはだかり…。

AIプログラムたちの妨害を受けるPlaymakerの下へブルーエンジェルが駆け付ける。彼女の活躍で窮地を脱したPlaymakerはマザーコンピューターの深部へと急ぐが、そこにある人物が立ちはだかる。

SOLテクノロジー社のデータバンクに侵入したPlaymakerの前に財前晃が立ちはだかって彼を制止する。しかし、復讐に燃える彼にその言葉は届かず、Playmakerはデュエルでの決着を晃に求める。

「ティンダングル」デッキを操る財前晃に対し、Playmakerhaサイバースで対抗する。データバンク内で繰り広げられる激しい攻防の中、晃は10年前に起こった事件について語り始め…。

あらゆる手段で財前晃はPlaymakerを追い詰める。しかし、Playmakerは最後の力を振り絞って連続リンク召喚で逆転の一手を狙う。そして、2人のエースモンスターが激しく激突し…。

遊作は草薙と共にSOLテクノロジー社のデータ解析を進め、10年前の事件の新たな真実を知る。一方、遊作の家ではAiとAIプログラムのロボッピによる秘密の悪巧みが行われようとしていた。

Den CityでLINK VRAINSからログアウトできずに現実世界で意識不明になってしまう謎の現象・アナザーが次々と発生。遊作たちはその原因を調査し、これ以上の被害を食い止めるべく行動を開始する。

アナザー事件の被害者となった少年を救うため、Go鬼塚は犯人を名乗るドクター・ゲノムと対峙する。少年のためにも敗北が許されないGo鬼塚は、それまでのエンターテイメントスタイルのデュエルを捨てて…。

ドクター・ゲノムの戦術に翻弄され、Go鬼塚は絶体絶命のピンチに陥ってしまう。一方、Go鬼塚たちの戦いとは別に、ハノイの騎士の集団がLINK VRAINSに現れ、街の人々に無差別攻撃を始める。

ハノイの騎士とPlaymakerたちの死闘を知った葵は、ブルーエンジェルとして戦いたい思いと、兄・晃と交わしたLINK VRAINSに入らないという約束の間で葛藤する。そんな彼女の下にエマが現れ…。

トリックスターの戦術をことごとく封じられたブルーエンジェルは、バイラが持つダークマミーの攻撃によって大ダメージを受けてしまう。後がなくなった彼女は大きなリスクと知りながら最後のチャンスに全てを懸け…。

「アナザー」事件によって人々はおびえ、LINK VRAINSは今も厳戒態勢となっていた。そんな中、LINK VRAINSに人一倍の憧れを抱く島直樹は、ハノイの騎士に立ち向かう決意をする。

島を人質にPlaymakerを呼び寄せた「アナザー」事件の首謀者・ファウスト。彼は「電動蟲（モーターワーム）」を操り、これまでにない戦術でPlaymakerのリンク召喚を封じることに成功する。

ハノイの騎士の魔の手はLINK VRAINSだけにとどまらず、現実世界にまで広がった。迫り来る脅威に危機を感じた草薙は、ハノイの騎士とロスト事件の関係、そしてアナザー事件の真相を記録に残し始める。

遊作はアナザー事件にリボルバーが姿を見せなかったことに疑問を抱いていた。その疑問を解消しようとLINK VRAINSで調査を始めた遊作は、同様に調査を進めていたゴーストガールと遭遇する。

ゴーストガールと彼女の前に姿を現したリボルバーのデュエルが始まった。トポロジック・ボマー・ドラゴンを退け、ゴーストガールは切り札のオルターガイストをリンク召喚。リボルバーに止めの一撃を放つが…。

LINK VRAINSに突然不気味な塔が出現し、デュエリストたちをデータ化する事件が頻発。それを知ったPlaymakerはゴーストガールに託された情報を元にLINK VRAINSへ向かう。

「トリックスター」デッキで攻めるブルーエンジェルの攻撃は、「聖天樹（サンアバロン）」に守られたスペクターに届かない。そこでブルーエンジェルは一撃必殺のコンボをスペクターに浴びせるが…。

スペクターの「聖天樹（サンアバロン）」は成長するたびにブルーエンジェルを追い詰めていく。徐々に動きを封じられていくデュエルの中で、ブルーエンジェルはスペクターの鉄壁の布陣を攻略する奇策を思い付く。

LINK VRAINSの崩壊を防ぐため、ハノイの塔へと向かうPlaymakerの前にスペクターが立ちはだかる。Playmakerはサイバースたちで大ダメージを狙うが、コンボにより防がれてしまい…。

ありとあらゆるダメージに対してライフポイントを回復して「聖蔓（サンヴァイン）」を呼び出す「聖天樹（サンアバロン）」に、攻めの手を緩めないPlaymaker。ついにその弱点を発見し、反撃へと転じる。

「エクスコード・トーカー」で「聖蔓（サンヴァイン）」の猛攻に耐えるPlaymaker。そんな彼を仕留めるべく、「聖天樹（サンアバロン）」は最終段階へと成長して得た、恐るべき効果を武器に襲い掛かる。

ハノイの塔の脅威が刻一刻とLINK VRAINSへ広がる最中、リボルバーはこれまでの戦いの中でより覚悟を強めていく。そして、鴻上博士の思いを受け継いで、作戦を遂行するために動き出す。

ハノイの塔はLINK VRAINSのあらゆるものを次々と飲み込みながら、完成へと近づいていく。タイムリミットが迫る中、塔を目指すGo鬼塚はリボルバーと対面。そしてGo鬼塚はリボルバーにデュエルを挑む。

リボルバーの戦略によって次々にモンスターを破壊されるGo鬼塚。しかし、不屈の闘志で立ち上がり、絶体絶命の窮地を乗り越えて最強のエースモンスター「剛鬼ザ・ジャイアント・オーガ」を召喚する。

完成目前のハノイの塔を前に、ついに宿命の敵・リボルバーと対面したPlaymaker。ネットワークの崩壊が迫る世界の命運、そして「ロスト事件」の真実を懸けた、2人の最終決戦が今始まろうとしていた。

リボルバーが操るリンクモンスターの強襲を耐え抜いたPlaymakerは、ハノイの塔の中心部にうごめくモンスターの気配を感じ取る。そして内部へと突き進み、勝敗を懸けて決死のドローに挑む。

リボルバーの正体に気づいたPlaymakerだったが、突然の衝撃の影響で強制的にログアウトさせられてしまう。遊作はハノイの塔の完成を止めるべく、現実の世界でリボルバーがいると思しき場所へと向かい…。

イグニスに隠された真実とロスト事件の真相を知ったPlaymakerは、ハノイの塔の完成を止めるようにリボルバーを説得する。しかし、その想いはリボルバーに届かず、最後の望みを新たなエースモンスターに託す。

リボルバーの猛攻が続くなか、幾多もの「コード・トーカー」の力を使って態勢を整えたPlaymaker。しかし、リボルバーはエースモンスター「ヴァレルロード・ドラゴン」でそれを迎撃し、「究極の布陣」を作り出す。

残りわずかなライフで耐えるも、ついに後がなくなってしまったPlaymakerとAi。しかし、2人はまだ諦めてはいなかった。リボルバーが作り上げた完璧な戦術を乗り越えるため、Playmakerは最後のドローに全てを懸ける。

LINK VRAINSはハノイの騎士の計画により壊滅的なダメージを受けていた。そこでSOLテクノロジー社はLINK VRAINSを再建し、「新生LINK VRAINS」を公開。生まれ変わったデュエルの世界に人々は喜んでいたが…。

草薙の弟・仁を襲った謎の人物を追いかけてデュエルを挑むPlaymaker。しかし、謎の人物の使う未知なるカードによって苦戦を強いられる。勝利の糸口を探るPlaymakerは、Aiから渡された新たなカードで攻勢へと転じる。

Playmakerは仁の意識を奪ったボーマンと名乗るデュエリストを追う。しかし、新たに彼の前に現れた2人のデュエリストによって行く手を阻まれてしまう。その時、謎のデュエリスト・Soulburnerが駆けつけ…。

遊作と同じ学校に転校してきた穂村尊の正体は、Playmakerに手を貸したSoulburnerだった。遊作の同級生になった彼は、自身の持つイグニスと共にサイバース世界の崩壊、そして新たなる敵の存在について語り始める。

SOLテクノロジー社のバウンティーハンターとなったGo鬼塚は、指名手配中のPlaymakerとイグニスであるAiを見つけ出し、デュエルを強要する。だが、そこに現れたSoulburnerがPlaymakerを守るためにデュエルを挑む。

Go鬼塚の操る「ダイナレスラー」デッキの猛攻を、「転生炎獣（サラマングレイト）」の効果で耐えるSoulbuner。最強を証明するために迫るGo鬼塚に対し、負けられない理由を持つSoulburnerがその拳に逆転の炎を宿す。

賞金首であるPlaymakerに対して、バウンティハンターのブラッドシェパードはデュエルを強制する。彼はPlaymakerの布陣を予想し、「ドローン」デッキによるコンボでPlaymakerの戦略を徹底的に封じ込める。

ブラッドシェパードの「ドローン」デッキを前に、手も足も出ないPlaymaker。迫り来るドローンの追撃によって追い込まれたPlaymakerは、ブラッドシェパードの作戦を打ち破るためにある秘策を実行する。

風が吹き荒れる断崖を訪れたPlaymakerとSoulburner。不思議な力によって遺跡へとたどり着いた2人は、その内部の調査を開始する。そして、遺跡の奥に入り込んだ彼らは意外な人物に出迎えられ…。

風のイグニスからの依頼を受けたsoulburnerは、風のエリアに侵入したブルーガールとのデュエルを開始。「トリックスター」のダメージを受けながらも、soulburberは「転生炎獣ヒートライオ」を呼び出し攻勢に出る。

ボーマンの居場所を突き止めたPlaymakerは、奪われた草薙仁の意識を取り戻すためにデュエルを挑む。過去にボーマンに勝利した時のデュエルから、相手の戦術を予測しながら進めるPlaymakerだったが…。

変貌したボーマンの猛攻によって大ダメージを受けるPlaymaker。しかし、勝利を掴むため闘志を燃え上がらせ、凶悪な「ハイドライブ」の布陣を突破する。だが、ボーマンは誰もが予想だにしなかった驚愕の行動に出る。

過去に「Den City」をパニックに陥れた「アナザー」事件の後、首謀者の1人として収容所に収監されていた「ハノイの三騎士」のバイラ。厳重な監視下に置かれている彼女の前に、ある男が姿を見せる。

Playmakerの正体について調べる別所エマと財前葵は、彼の親友と豪語する島直樹に目をつける。エマはゴーストガールへと変身し、島のアバターであるブレイブ・マックスへデュエルを持ちかける。

草薙の連絡を受けて、PlaymakerとSoulburnerは新たに出現したゲートへ向かう。しかし、そこに仕掛けられていたブラッドシェパードのわなによってSoulburnerは捕らえられ、秘めていた過去を探られてしまう。

捕らわれたSoulburnerを救出するため、Playmakerはバウンティハンターの剣持、鎧坂に勝負を挑む。一方、Soulburnerはブラッドシェパードのわなにより、過去の秘められた記憶を掘り起こされてしまう。

Soulburnerの記憶を探り、その弱点を見抜いたブラッドシェパードは、「ドローン」モンスターによる凶悪なコンボで圧倒的な優位を築く。絶望的な状況となり、追い込まれていくSoulburnerだが…。

ある日、草薙のもとへ向かおうとする遊作と尊の前に島が現れ、遊作を呼び止める。仕方なく1人で向かった尊は、草薙に遊作との出会いについて尋ねる。すると、草薙は2人が出会った時の話を語り始め…。

都市伝説として記された、LINK VRAINSに眠る謎のダンジョンには、数々のわなが張りめぐらされていた。その先にはサイバースデッキが眠るというが…。そして、草薙の口からPlaymakerの誕生秘話がついに明らかになる。

ネット上に書かれた情報について調査を進めるAiは、ある時イグニスに関する不審な書き込みを発見する。その真偽を確認するためにLINK VRAINSへ向かったPlaymakerとAiを、地のイグニスが待ち受けていた。

水のイグニスからサイバース世界の危機を知らされた地のイグニスは、人間という存在を見極めるためにPlaymakerに勝負を挑む。「Gゴーレム」の攻撃により窮地に立たされたPlaymakerは、わずかな可能性に望みを託す。

Aiが突如姿を消した原因がほかのイグニスにあると突き止めたPlaymakerは、Aiを捜索するために向かったLINK VRAINSで光のイグニスと遭遇。そして、光のイグニスの目的とサイバース世界の崩壊に隠された真実を知る。

イグニスを殲滅するため、リボルバーはウィンディたちの居場所を襲撃する。Playmakerは人類とイグニスの争いを止めようとリボルバーを説得するが言葉は届かず、彼はウィンディとデュエルを開始してしまう。

ウィンディの巧妙なデュエルに追い詰められるリボルバー。戦いのなか、ウィンディの秘められた凶悪な一面が明らかに。イグニスの真意を知るリボルバーは鴻上博士の目的を遂行するため、新たな戦術で勝負を仕掛け…。

人類とイグニスの共存を目指すPlaymakerの想いもむなしく、光のイグニスは人類に対して宣戦を布告。人々をイグニスに支配下に置くために動き出す。そして、光のイグニスと共闘するボーマンがPlaymakerに戦いを挑む。

進化を遂げたボーマンは、新たなハイドライブの戦術を見せる。対するPlaymakerはこれまでのボーマンとの戦いから戦術を予測し、Aiの助言を受け入れて攻め込む。研ぎ澄まされた読み合いのなか、2人の戦いは激化し…。

激しい攻防が続くなか、ボーマンはスキル・Storm Accessを発動し、新たな“ハイドライブ”を手にする。壊滅的なダメージを受けて絶体絶命となったPlaymakerに、Aiは事前に用意していた秘策を打ち明ける。

何者かに幽閉されていたアクアを救出したアースは、サイバース世界崩壊の真相を明かされる。しかし、そこに現れたイグニスの確保を命じられたGo鬼塚がアースとアクアに襲いかかり、デュエルが幕を開ける。

アースたちのデュエルに駆けつけたPlaymakerは、Go鬼塚の異変に気づく。以前にも増して強力な戦術で戦うGo鬼塚は、「ダイナレスラー」でアースを圧倒。さらにGo鬼塚は予想だにしない驚愕の戦法を見せる。

SOLテクノロジー社のやり方に疑念を抱く葵は、行方不明のアクアを捜索する。一方、アクアの居場所を掴んだブラッドシェパードは、イグニスを抹殺するため攻撃を仕掛ける。そんな彼の前にゴーストガールが現れる。

アクアを守るため、ゴーストガールはブラッドシェパードの前に立ちはだかる。しかし、イグニス追撃の邪魔をされたブラッドシェパードは激高し、負ければアカウントを失うデュエルをゴーストガールに突きつける。

SOLテクノロジー社に隠された衝撃の計画を知ったブラッドシェパードは財前のもとを去り、独自にイグニスの捜索を始める。リボルバーはそんな彼の並外れたハッキング能力に目を付けて共闘を持ちかける。

リボルバーの暗躍を警戒するライトニングは、単独でイグニスを捜索するブラッドシェパードにデュエルを挑む。だが、ブラッドシェパードはこれまでとは違うドローンの新戦術でライトニングを圧倒する。

相手の戦術を抑え込んで優勢に立つブラッドシェパードだが、ライトニングは次々とモンスターを呼び出してドローンを迎え撃つ。やがて拮抗する2人の戦いは、誰もが予想できない境地へと達していく。

ライトニングの動向を調べていたPlaymakerたちは、SOLテクノロジー社に捕らえられていたアースの痕跡をLINK VRAINS内で発見する。現場へ向かったPlaymakerたちを、AIと一体化したGo鬼塚が待ち受けていた。

変わり果てたGo鬼塚の猛攻を何とか耐え凌ぐPlaymakerは、スキルを発動して逆転の糸口を掴む。しかし、Go鬼塚の「アンチスキル」によってスキルが無効にされて、絶体絶命のピンチへと陥ってしまう。

リボルバーから連絡を受けたPlaymakerは、仲間たちを招集して指定された場所へと向かう。そこでPlaymakerたちはリボルバーから共闘を持ちかけられる。しかし、Soulburnerはロスト事件で心に深い傷を負っていて…。

リボルバーから共闘を持ちかけられたPlaymakerたちだが、怒りに震えて反発するSoulburnerはリボルバーとデュエルを開始する。リボルバーへの憎しみを爆発させたSoulburnerは、怒涛の攻撃を繰り広げるが…。

ミラーLINK VRAINSへ突入したPlaymakerたちは、ライトニングのもとへ突き進む。その一方では、ライトニングから指示を受けたハルがブルーメイデンの前に立ちはだかり、2人はデュエルを開始する。

ライトニングは、「天装騎兵（アルマートス・レギオー）」と「裁きの矢（ジャッジメントアローズ）」で作り上げたエクストラ・リンクでスペクターを追い詰める。しかし、彼は用意していた驚がくの秘策を披露し…。

ライトニングの「裁きの矢」を逆手に取り、エクストラ・リンクを見事に打ち破って戦況を逆転させたスペクター。「聖天樹（サンアバロン）」で覆い尽くされた戦場で、スペクターはライトニングへ猛追する。

復活したウィンディは、リボルバーとの決着をつける前にライトニングの作戦を遂行するためSoulburnerに襲いかかる。人間に対する憎しみが増幅したウィンディの激しい攻撃に、Soulburnerは立ち向かう。

ウィンディの「嵐闘機（ストームライダー）」の攻撃により、Soulburnerは絶体絶命のピンチへと追いやられる。だが、その胸中の炎は消えてはいなかった。彼はウィンディが自身のパートナーに手をかけた理由を知り…。

ブルーメイデンの前に、次世代のイグニスになろうとするボーマンが立ちはだかる。アクアはボーマンの思想を拒絶し、ブルーメイデンは美優の意識を取り戻すために勝負を挑む。対するボーマンは不気味なほど冷静で…。

これまでの戦いのデータをもとに、より強力な戦術を身に着けたボーマンは、進化した“ハイドライブ”でブルーメイデンを瞬く間に追い詰める。だが、彼女は諦めることなくボーマンに立ち向かう。

Playmakerの前に敵として現れたのは、彼ただ1人を除いて、誰も想像できなかった人物であった。Playmakerの目の前に立ちはだかる親友・草薙翔一は、ライトニングに弟・仁を人質として取られてしまっていて…。

Playmakerのデッキを知り尽くしている草薙翔一は、弟・仁を守るため容赦なく攻撃を仕掛ける。Playmakerが相棒を相手に攻撃できず、残りライフもわずかななか、草薙が過去に2人で交わした約束について話し始める。

草薙との戦いで意識を失ったPlaymakerを守るため、ボーマンとのデュエルを開始するSoulburner。ライトニングの非道なやり方に怒るSoulburnerに対し、ボーマンは不気味な笑みを浮かべながら語りかける。

人知を超える力を手にし、運すらも自在に操ると豪語するボーマン。一方、Soulburnerと不霊夢は熱い絆を武器に「転生炎獣（サラマングレイト）」でボーマンを追い詰めていく。そんななか、不霊夢に異変が起き…。

ライトニングが自分のもとに来るように仕向けたリボルバーによって、ライトニングが犯した罪とボーマンを作り出した本当の理由が明かされる。今まで冷静だったライトニングは怒りを露わにしてデュエルを挑む。

それぞれのイグニスと人類の未来に関するシミュレーションで、ライトニングの結果だけが人類とイグニス共に破滅する未来になると告げるリボルバー。デュエルでも優位に立った彼は、新たなヴァレルロードを呼び出す。

ライトニングは草薙仁を人質に取り、リボルバーの動揺を誘う。しかし、その行為に失望したボーマンがライトニングを制止する。作戦に失敗したライトニングはリボルバーに、鴻上博士にまつわる衝撃の真実を明かし…。

Playmakerはイグニスを取り込んだボーマンと対峙する。その一方で、LINK VRAINSに閉じ込められたアバターが次々に倒れる謎の現象が起こり始める。さらにボーマンは強大なData Stormを巻き起こし…。

ボーマンはLINK VRAINSの人々の意識を利用してData Stormを作り出し、強力な「ハイドライブ」モンスターを召喚。その対抗策を見出せないPlaymaker。それを見ていたハノイの3騎士たちは、状況を打開すべく動き出す。

ハノイの3騎士や戝前・ゴーストガールによる命懸けの協力で、ニューロンリンクがついに破壊される。しかし、すぐさまその復元を始めるボーマンを前にPlaymakerはさらに絶望的な状況に陥ってしまう。

ニューロンリンクの一部を破壊し、ボーマンのプログラム内へ侵入したAiは、その中で完全に取り込まれてしまった5体のイグニスを発見。Aiはそのイグニスたちが残した最後の希望をPlaymakerへ託す。

世界の命運を懸けたボーマンとの激闘を終えたPlaymakerは、仲間たちの意識が解放されたことに安堵する。だが、戦いによって力を使い果たしたAiや、ボーマンに取り込まれたイグニスたちが戻ることはなく…。

Playmakerたちの活躍によって平穏が訪れたDen City。だが、その一方でAiはロボッピと共にSOLテクノロジー社の船に潜入する。そこでAiはある目的を果たそうと、最高幹部であるクイーンへの接触を試みる。

クイーンを襲撃したAiは、SOLテクノロジー社のシステム内部への侵入に必要なコードキーを奪うために財前に犯行を予告する。これまで共に戦ってきたAiが人間を襲い始めたことにPlaymakerは複雑な想いを抱き…。

Playmakerは財前を狙うAiを捜索するが、見つけたのは時間を稼ぐために作られたコピーのAiだった。ほかの仲間たちもコピーAiとの戦いを繰り広げるなか、ブラッドシェパードとゴーストガールはロボッピと遭遇する。

ゴーストガールとブラッドシェパードをトリッキーな戦術で追い込むロボッピ。窮地の2人は協力して新たな切り札を呼び出し、反撃の態勢を整える。一方、オリジナルのAiを発見したGo鬼塚もデュエルを開始する。

施設の子供たちを守るために復活したGo鬼塚。「剛鬼」による怒涛の攻撃で奮闘するも、Aiの強力なモンスターに一掃されてしまう。しかし、不屈の闘志を燃え上がらせGo鬼塚は、何度でも立ち上がりAiに挑み続ける。

自らの計画を遂行するためにPlaymakerの仲間たちを次々に襲撃するAiは、ついに財前が避難している場所を特定する。そんなAiの動きを察知したリボルバーは、財前を守るためにAiの行く手にパンドールを出撃させる。

ネット空間で財前とブルーメイデンを発見したAiは、SOLテクノロジー社のシステムを掌握しようと彼らにデュエルを挑む。Aiの猛攻に対して互いを守りながらしのぐ2人は、それぞれの想いをひとつにして反撃に出る。

財前とブルーメイデンは互いの戦術を駆使してAiの布陣を突破。しかし、Aiは新たな切り札を呼び出して再び2人を追い詰めていく。だが、諦めずに戦う兄妹の強い絆が、新たなエースモンスターを呼び起こす力となる。

閉鎖されていたはずのLINK VRAINSが突然開放され、Den Cityの人々が一斉にログインを始める。一方、SoulburnerはSOLテクノロジー社を乗っ取ったAiの手がかりを探すため、LINK VRAINS内の調査を始める。

Aiの居場所を突き止めるため、Soulburnerはロボッピとデュエルすることに。彼は人間と共に歩む道を探すようロボッピを説得するが、ロボッピはAiを苦しめている原因が不霊夢を守れなかったSoulburnerにあると言う。

Soulburnerとのデュエルを通して進化していくロボッピは、変幻自在の戦術で彼を追いつめる。だが「機塊」の軍勢による激しい攻撃を耐え凌ぐSoulburnerも反撃に出る。そんななか、ロボッピにある異変が起こる。

Aiに関する情報が記されたデータを受け取ったSoulburnerのもとに現れたリボルバーは、自身の手でイグニスとの因縁を終わらせるため、Aiのデータを奪おうとする。Aiの情報を懸けて、2人の2度目の対決が始まる。

戦いが激化するなか、リボルバーはSoulburnerが抱える心の迷いに気づいて失望する。それに激高したSoulburnerは、ロスト事件で受けた心の傷、不霊夢を失った悲しみ、全ての迷いを断ち切って右手に劫火を宿らせる。

Aiの居場所を知った遊作はDen Cityの郊外にある島へ1人で向かう。SOLテクノロジー社が開発したソルティスを使って自身のコピーを作り始めていたAiは、遊作に人々を襲った目的と内に秘めた想いを語り始める。

Playmakerは次々に繰り出されるAiの攻撃を紙一重で避け、Aiの戦術の隙を突いて攻撃を仕掛ける。しかし、Playmakerを知り尽くすAiにとって、全ての行動は想定内だった。そしてAiはイグニスたちの想いを収束させ…。

イグニスを失ったことによるAiの悲しみを知ったPlaymakerは、Aiに戦いを止めるように説得する。だが決心したAiの気持ちは変わることはなかった。そして2人がしのぎを削るなか、AiはPlaymakerにある提案をする。

人間が持つつながりの大切さと、AIが求める絶対的なもの。PlaymakerとAiはお互いの意思を改めて再認識する。そして、2人は戦いの終わりに向けて残された力を解放し、未来を掴み取るためのデュエルに挑む。